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oPools Oligo Pools

oPools Oligo Poolsは、大量の1本鎖DNAを1本のチューブ形式で納品するサービスです。1本のチューブに多種の１本鎖DNAを入れて納品するため、プール形式と呼ばれています。

oPoolsは、IDTのサービスの中でも1塩基あたりの価格が安価で、350塩基まで合成可能です。そのため、CRISPRライブラリーの作製やマルチプレックスPCR用プライマープールの作製、データストレージ、遺伝子構築などに有用です。


本サービスは、弊社が独自に開発してきたDNA合成装置を用いて、核酸を迅速かつ高品質に合成しています。この合成装置は、Ultramer合成と同等の技術を用いているため、高い品質の1本鎖オリゴを合成可能です。

長鎖のオリゴには精度の高い「extra rich」という合成サイクルを用いています。さらに、最大350塩基の高品質オリゴの合成専用に最適化したユニークな担体を用いています。

価格

スケール(pmol/オリゴ) プールごとのオリゴ数 オリゴ長(塩基数)
1 100～20,000 40～350
10 10～2000
50 2～384
※乾燥品をチューブに入れて納品します。

塩基数 価格
1～3300 ¥10,970 均一
3301～50000 ¥3 /base
50001～100000 ¥2 /base
100001～ ¥1 /base


価格例
■ 100塩基(1pmol)のオリゴを300本合成した場合

100塩基 x 300本 = 30,000塩基
¥10,970 + (30,000 - 3,300) x ¥3
= ¥91,070
■350塩基(50pmol)のオリゴを9本合成した場合

350塩基 x 9本 = 3,150塩基
（3,300塩基以下のため）
¥10,970


oPools Oligo Pools サービス詳細

合成可能塩基数 40～350塩基/オリゴ
納品スケール (オリゴ数)
※納品スケールの詳細については
こちらをご参照下さい。		 1 pmol/オリゴ (100 ～ 20,000オリゴ/チューブ)
10 pmol/オリゴ (100 ～ 20,00オリゴ/チューブ)
50 pmol/オリゴ (2 ～ 384オリゴ/チューブ)
混合塩基
(MIX塩基、ランダム塩基)		 N = A、C、G、T
K = G、T
• 1オリゴあたり混合塩基は3個まで
• ハンドミックスのみ
修飾 5′リン酸化 (¥85/修飾)
5'ビオチン化 (¥85/修飾)
QCおよび定量 なし
納品容器 2 mLチューブ


納品形態 及び 保存方法

  • 納品：乾燥品
  • 納期：注文後6～10営業日で日本オフィスより出荷
  • 短期保存(最長6週間)：室温(15～25℃)または4℃
  • 長期保存(最長24か月)：–20℃


oPools Oligo poolsの特徴

oPoolsでは、高品質な核酸合成法を採用しています
人工的に合成するオリゴDNAは、ヌクレースで伸長させる方向とはことなり、3’末端側より1塩基ずつ合成します。 ヌクレオチドを1塩基伸長させる時の効率をカップリング効率と呼びますが、カップリング効率は核酸合成における非常に重要な要素の1つです。

oPoolsは、IDTの製品群の中でもカップリング効率が高い、ultramerというサービスと同等の合成法で用いています。下図は、カップリング効率とoPoolsの長さにおける品質を示しています。

図1. オリゴが正確に合成できる割合はカップリング効率によって決まる
oPools DNAオリゴは、カップリング効率が最も高いUltramerオリゴと同じ合成法で製造されるため、IDTの標準サービスや、業界標準と比較しても極めて高いカップリング効率を誇ります。

長鎖のオリゴを取得するためには、カップリング効率は非常に重要です。



oPools オリゴDNAの収量分布
下図は、oPools DNA オリゴの収量の均一性を示しています。

図2. oPools DNA オリゴの収量分布の均一性
この図は、収量分布の均一性の高さを平均との差（％）の関数として示しています。
50万個のオリゴ全体の標準偏差は平均値の23％未満です。これは、oPoolsの収量の均一性がとても高いことを示しています。例えば、1 pmolスケールをご注文頂いた場合、収量が0.77 pmol ～ 1.23 pmolの配列が68.3%の含まれていることを示唆しています。



ドロップアウト率について
ドロップアウト率とは、指定の配列が合成できておらず、プールにした際に配列が入っていない割合です。図3のように、oPools DNAオリゴ合成サービスは、IDTが独自開発を行った合成装置を用いているため、極めて低いドロップアウト率を示します。

図3. oPools DNA オリゴのドロップアウト率
ドロップアウト率は、配列の長さと複雑さによって変わります。
40～200塩基の範囲で90万本の配列を合成し、ドロップアウト率を調べたところ、oPools DNA オリゴの平均ドロップアウト率は1％未満でした。
この時のドロップアウト率を、塩基長の区分ごとに図示しました。


ご注文方法

現在準備中です。

ご注文はこちらからお願いします。
https://sg.idtdna.com/site/order/poolentry


Q&A

Q. oPoolsのオリゴはそれぞれ個別に製造されていますか？
A. はい。すべてのオリゴは1本1本別々に合成されます。出荷前に、すべてのオリゴを1本にまとめます（プールします）。

Q. oPoolsでは脱塩グレードや精製オプションを利用できますか？
A. oPoolsはできるだけ効率的に製造できるようにすることでコストを抑えています。そのため申し訳ございませんが、精製グレードのオプションの選択はできません。

Q. oPoolsのオリゴは他のIDTオリゴと同様品質の保証をしていますか？
A. oPoolsオリゴはQCチェックを行っておりません。そのため、個々のオリゴの配列のチェックや、純度の保証も行っておりません。過去のデータ上、注文頂いた配列の大部分は合成できていると予測できますが、それぞれのオリゴについて、必ず存在しているかどうかの保証はしておりません。過去のデータでは、合成できていない配列は1%未満でした（図3）。

Q. oPools DNA オリゴ合成サービスは、どのような品質チェックをしていますか。
A. oPoolsはできるだけ効率的に製造できるようにすることでコストを抑えています。そのため、品質チェックや純度保証は行っておりません。

Q. oPoolsのオリゴの溶液納品は可能ですか？
A. oPoolsはできるだけ効率的に製造できるようにすることでコストを抑えています。そのため、申し訳ございませんが、溶液納品は利用できません。oPoolsはすべて乾燥状態で納品されます。

Q. oPoolsの見積を簡単に取得する方法はありますか？
A. こちらのエクセルシートをお使い下さい。
Excel oPools用ランダム配列作成エクセル

[oPool calシート]では、oPools用にランダムな配列を作成することも可能です。
また、[oPools inquiryシート]では、塩基数のみで見積を作成可能です。

ただし、価格は状況によって変わる場合がございます。正式な見積は実際の配列をショッピングカートに入れてご確認下さい。
※2019/10/10 更新



分析証明書 (COAs） ＆ 安全データシート（SDSs）

分析証明書および安全データシートは下記のページよりご取得下さい。

https://sg.idtdna.com/pages/products/custom-dna-rna/dna-oligos/custom-dna-oligos/opools-oligo-pools